皮蛋可放在塑料袋内密封保存，置于阴凉通风处，一般可保存3个月左右而风味不变。不能将皮蛋放到冰箱里保存，甚至冷冻起来，皮蛋由碱性物质浸泡而成的，成胶状体，含水分约70%左右，经冷冻以后，水分会逐渐结冰。此时将松花蛋拿出来吃，冰会逐渐融化，其胶状体就会变成蜂窝状，改变了松花蛋原有的醇厚清香的风味，降低了食用价值。而且低温会使松花蛋色泽变黄，口感变硬，同正常的松花蛋差异极大。
皮蛋的保质期：一般情况下皮蛋可以保存3-5个月，如果是已经打开后的皮蛋，一定要在1-2小时内吃完，不要长时间暴露在空气中或放在冰箱里留着下顿吃，否则易感染沙门氏杆菌。因为沙门氏杆菌生长的适宜温度为20℃~37℃，它会与灰尘一起飘浮在空气中，遇到适合的载体就迅速繁殖。皮蛋正是这样一个载体，它能为沙门氏杆菌提供大量的营养，使细菌迅速繁殖，这种带菌蛋食用后会引起中毒。值得注意的是，感染此菌的皮蛋即使放在冰箱里，低温也阻止不了细菌的大量繁殖，只是使其不太活跃而已。
