奶茶的保存时间，和保存环境的温度有关。由于奶茶中含有蛋白质、糖分等，比较容易滋生细菌而变质，如果是在夏季高温环境中，奶茶一般常温放置超过8小时就不建议饮用了；但室温低于20度的时候，奶茶能够保存12小时以上；室温在10度以内时，奶茶保存24小时也没有问题。
冰箱冷藏层是一个低温环境，开封后的奶茶可以放在冰箱，但是，一般是用保鲜膜将杯口密封好，以防和空气中的细菌接触，引起细菌繁殖和奶茶串味的情况发生，影响口感。奶茶中主要的成分是牛奶和茶叶，以及一些其他成分，都是不易变质的原料，所以，喝不完的奶茶可以放在冰箱隔夜保存，隔夜之后茶叶中的茶多酚可能会出现氧化现象，外观上会出现轻微变化。
