刃牙监狱篇是第3季第3卷—第10卷,讲述了主角范马刃牙向监狱NO.1囚犯奥利巴发起挑战的故事。范马刃牙是板垣惠介《刃牙》系列漫画及相关动画主角,继承了范马之血的东京巨蛋地下竞技场王者,天才格斗少年。为了打倒父亲、也是地上最强生物“范马勇次郎”,自幼开始接受成为格斗家的训练。
13岁时,刃牙败给俄国重量级拳击手尤里·柴可夫斯基之后,为了彻底锻炼自己,前往飞驒山寻找父亲勇次郎的旧识安藤玲一。刃牙在这里打败了传说中的深山怪物夜叉猿。回到东京,得知尤里被一个年仅15岁的少年、黑道花山组二代目组长花山薰打败了,刃牙为了替尤里报仇,主动向花山薰发起挑战,并最终取得胜利。