不会，根据法律规定，驾驶机动车，应当依法取得机动车驾驶证。
“机动车”，是指以动力装置驱动或者牵引，上道路行驶的供人员乘用或者用于运送物品以及进行工程专项作业的轮式车辆。
“非机动车”，是指以人力或者畜力驱动，上道路行驶的交通工具，以及虽有动力装置驱动但设计最高时速、空车质量、外形尺寸符合有关国家标准的残疾人机动轮椅车、电动自行车等交通工具。
由此可见，电动车属于非机动车，与机动车驾驶证没有关系，电动车扣分了不会扣机动车驾驶证。
《机动车驾驶证申领和使用规定》第八条
《中华人民共和国道路交通安全法》第十九条
《中华人民共和国道路交通安全法》第一百一十九条
