御花园三奇石分别为木变石、诸葛拜北斗和海参石。
木变石另有硅化木、木化石、树化玉等称谓，属于化石类观赏石。始称见于唐宋时期，宋代《云林石谱》有述，故宫御花园唯此一件，且有乾隆御题之诗。
诸葛拜北斗石，从《观赏石鉴评》标准上看，依照形、质、色、纹、韵要素分析。
形：上大下锥椭圆形。
质：硅质化程度较高，卵石。
色：灰白底色和轻褐色组成图案。
纹：从图纹上看，虽历经百年，仍清晰可辨，画面感强，人物位置适中，形象生动，也是御花园唯一一方水冲画面石，而且是道家风格的石头。
海参石，系珊瑚排泄物化石，属于中型观赏石，为御苑传承石中仅见。造型独特，其形恰如一条条首尾相连的“海参”，因而被命名为“海参石”。该石呈半透明状，动感十足，石上布满毛绒绒的刺，憨态可掬，惹人驻足。
