1、含义不同：基金按照对象划分为股票型基金，债券基金，社保基金，混合基金等，而机构是指除个人投资者以外的机构，因此不止包含了基金，还有保险，券商，信托等。
2、持股比例不同：如股票基金持仓投资比例不得低于80%用于投资者股票，混合偏股型基金投资股票要在50%~70%之间，社保基金入市比例不得超过30%等。但是机构持仓就没有限制。
3、投资目的和期限不同：基金是为了中长线的价值，所以部分上市公司大股东名单中可以看到基金持股，它不会随时变化或退出，因此买卖股票也受到限制。但是机构投资者的目的是为了短期的利益，一般通过拉高股价，再出货获得收益。
4、信息披露不同：基金每日公布净值，会公布月报，季报，半年报，年报等。但是机构不会发布自己盈利亏损情况。
