1、认定条件不同：年应税销售额未超过规定标准的纳税人，会计核算健全，能够提供准确税务资料的，可以向主管税务机关办理一般纳税人登记；小规模纳税人是指年销售额在规定标准以下，并且会计核算不健全，不能按规定报送有关税务资料的增值税纳税人。
2、税收管理规定不同：一般纳税人销售货物或提供应税劳务可以开具增值税专用发票，购进货物或应税劳务可以作为当期进项税抵扣，计算方法为销项减进项；小规模纳税人只能使用普通发票；购进货物或应税劳务即使取得了增值税专用发票也不能抵扣；计算方法为销售额*征收率。
3、税率及征收率不同：一般纳税人的基本税率17%，税法还列举了5类适应13%低税率的货物，还有几项特殊业务按简易办法征收（参照小规模）以及零税率应税劳务和货物；小规模纳税人则是商业规模的不同按4%或6%征收率进行征收（免税的除外）。
