1、消费场景不同：微信分付，据官方介绍，用户可在吃饭、购物、看电影等支持微信支付的消费场景，选择分付额度进行支付，但暂不支持用于发红包、转账、取现。可以看成是微粒贷在消费信贷领域的补充。花呗，可以在线上支持花呗付款的商家以及线下花呗收款商家支付。如果有花呗当面花的还能在非花呗收钱商家，单笔订单金额在150(含)元以内都可以用花呗消费，同样也不支持转账、发红包、取现。
2、免息期不同：微信分付是不免息的，比较偏向于消费贷款，从使用当天起按日计息，虽说微信方面是说200用一天每天利息几分钱，但按日利率0.04%推算，分付的年化利率在14%左右，还是比较高的。花呗，和信用卡比较接近，都有免息期，据说有41天，从消费当天起到第41天，在还款日全额还款都是不收利息的。
3、还款方式不同：微信分付是随借随还的，没有固定还款日期，每期最低还10%就行了，还可以提前还款，分期还款。花呗有固定还款日，本来是每月9号或者10号，可通过修改还款日分别变成每月15号或者20号，在还款日系统自动扣款，同样支持分期还款、提前还款，还可以延长还款期限。
