保温杯焖粥不利于身体吸收营养。开水的沸点是100度，而大米的热熟点是120-150度，也就是说开水泡大米只是八成熟，虽然可以食用，但长时间食用未熟透食物，对身体还是有影响的，从营养学角度来说，未熟透的食物也不利于身体吸收。
保温杯焖粥本身的营养大部分流失。蛋白质、无机盐等营养素在烹调时的过程中，营养可能不会有很多的损失。但随着加热或保温时间的变长，维生素B1一般可能会损掉一半甚至是更多。如果煮粥的时候，还会往里面放碱，那么维生素B1可能也就流失得比较严重了。
保温杯焖煮粥容易有细菌滋生。保温杯中的温度和湿度都刚刚好，很容易引起细菌的快速生长，从而引起胃肠道功能失调，腹泻，肠胃炎疾病，所以说不建议在保温杯里面放置食物，尤其是长时间的放置熟食。所以使用保温杯焖的粥要尽早吃掉。
使用保温杯装液体，也要注意：保温杯不宜装酸性饮品。不锈钢由于熔点较高，不会因高温溶化释出不良物质。但是不锈钢最怕强酸，如果长时间装载酸性较强的饮品，很可能会对其内胆产生损伤。保温杯不宜装牛奶。一些人会把热牛奶装在保温杯内，不过，这种做法却让牛奶中的微生物在适宜温度下会迅速繁殖，导致腐败。牛奶在高温环境下，维生素等营养物质会被破坏。同时牛奶中的酸性物质还会与保温杯内壁发生化学反应。无论是牛奶还是酸性果汁，最好都要在一定的时间内喝完。
