扇贝的消化腺和鳃部位不能吃。扇贝可食用部分是白色的闭壳肌、片状呈红色或白色的生殖腺和裙边，而黑色的消化腺和鳃结构都不能食用。因为扇贝的消化腺相当于动物的下水，其中有排泄的废物、毒素、重金属或泥沙，食用对人体危害很大。最好在烹煮前去除，以免污染其他可食部分。
扇贝主要吃什么部位
扇贝属于软体动物门，扇贝科，是我国重要的贝类养殖品种。扇贝可食部分的主要营养成分为蛋白质，与鱼类、虾类相似，是一种集食、药、滋补为一体的重要水产食物。扇贝的主要的食用部分是闭壳肌，即扇贝柱，其肉质细嫩，味道鲜美，是营养价值极高的保健食品。
扇贝闭壳肌的干制品俗称干贝，是我国传统的“海八珍”之一，深受消费者喜爱。首先，应选择外壳颜色比较一致且有光泽、大小均匀的扇贝，不能选太小的，否则因肉少而食用价值不大;然后，看其壳是否张开， 活扇贝受外力影响会闭合，而张开后不能合上的为死扇贝不能选用。
刷干净扇贝外壳后，可以在淡盐水中浸泡，让其吐尽泥沙即可。洗净后，将壳撬开或焯烫至壳自动打开后捞出，将贝柱边上黑色部分，也就是内脏摘掉丢弃。贝壳食物中毒一般是双壳类引起的，所以内脏一定要去除。购买时要注意买壳紧闭的活生蚝和扇贝，但久煮不开口说明已经死掉。
