原料不同：胡椒粉选用的是热带植物胡椒树的果实—胡椒；花椒粉选用的是芸香科灌木或小乔木植物青椒的干燥成熟果皮—花椒。
制法不同：花椒粉的制作过程比胡椒粉略为复杂，胡椒粉是将胡椒果实碾压成末制成；而花椒粉在碾压成末之前，还要经过炒制的过程。
口感不同：从口感上看，胡椒粉味道偏辣中带苦，花椒粉味道偏麻中带辣。
用途不同：从用途上看，胡椒粉属于药食两用食材，黑胡椒粉多用来给荤类食材去腥，或者烹制红肉类食材，白胡椒粉多用来炖肉炖汤；而花椒粉是川菜必备的调味品，用途比较广，可以在制作菜肴时使用，也可以和盐一起做蘸料。
