二套房公积金贷款的利率为公积金基准利率1.1倍，如果是五年期以上的房产的话就是3.25%的1.1倍，即为3.575%。虽然比起首套公积金贷款的利率要高一点，但是对比商业贷款的利率整体还是要划算很多的。
公积金贷款和商业贷款的区别
一、面对的房屋类型不同
1、住房公积金贷款只能用于购买70年产权的住宅时使用，除此之外的商办房等类型的房屋是不能申请公积金贷款的。因此大家买房申请贷款时请一定要注意这一点。
2、商业贷款面对的房屋类型较为宽松，除了住宅之外，公寓也可以申请。
二、贷款利率的不同
这是因为公积金贷款不是以盈利为目的的政策性贷款，因此它的利率相对较低。而商业贷款就不同了，商业银行贷款是以赢利为目的，利率相对高一些。
三、贷款额度不同
一般来说，如果商业贷款和公积金贷款购置同样的一套房子，那么商业贷款的首套房子可以贷到70%。而纯公积金贷款的首套则最多可贷款到80%。
四、贷款流程不同
1、公积金贷款
公积金贷款的流程一般是：资质审核、房屋核验——网签——评估——面签——初审——签借款合同——缴税——过户——出房产证——抵押——放款。
2、商业贷款
商业贷款的流程一般是：资质审核、房屋核验——评估——同贷——网签——缴税——过户——出房产证——抵押——放款。这样对比来看，公积金贷款和商业贷款明显是有很大区别的。
五、还贷方式不同
另外商业贷款可以选择的还贷方式非常多，在提前还款的上也更为自由、灵活。一般商业贷款在满一年后，每年都可以提前还款。相比之下，公积金贷款的还贷方式较为单一，以等额本息和等额本金两种方式为主。此外，公积金贷款只有一次提前还款的机会。
六、审批时间和机构不同
1、商业贷款大约需要20个工作日出审批结果。而公积金贷款则大约需要40个工作，这主要是因为公积金审核完之后还要交给银行再审查一次。
2、商业房贷主要通过银行审批，决定权在银行。公积金房贷则需要通过公积金管理中心审批，决定权在公积金管理中心，银行只是执行机构。
七、面对的人群不同
商业贷款是公开性的，只要符合贷款的条件则都可以进行贷款。而公积金贷款需满足公积金按月足额缴存6个月以上，具有稳定的职业和收入才可以进行申请贷款。相对商业贷款而言，公积金贷款的要求更高些。
