银杏种子共有3层外皮,它的最外层是HS的肉质皮,上有一层淡淡的白粉,叫“外种皮”;中间是白色坚硬的白果壳,即“中种皮”;硬壳内的白果仁外侧则是一层红色的薄膜,叫“内种皮”。外种皮中含有丁酸和己酸等多种挥发性物质,正是这些具有较强腐蚀性的物质使银杏种子在成熟时散发出阵阵酸臭。古人对银杏果的特性显然早有所知,宋人张无尽的“玉纤雪腕白相照,烂银破壳玻璃明”写出了银杏果外皮的特征,梅尧臣的“剥核手无肤,持置宫省曹”则告诉人们银杏的表面具有较强的腐蚀性。
外种皮中的酸臭是银杏种子的最好保护。一些消化能力强的动物,对这种臭味敬而远之,而果子狸等动物吃下银杏种子之后,只能消化掉白果硬壳外侧的肉质部分,内部的白果则可以在坚硬的中种皮的保护下完好地被排泄出来,继续繁衍生长。