社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。因此异地生孩子农村合作医疗是需要按照以下方式进行报销的：1、在办理出院时，需要让医院把所有报销的材料出具给病人；2、报销人需要拿着医院出具的相关材料，去当地的社会保险经办机构申请异地报销；3、社会保险经办机构会对材料进行审查；4、认为符合报销情形的，给予报销。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第二十九条参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。
