大病医疗抵扣个税享受扣除时间为医疗保障信息系统记录的医药费用实际支出的当年；如果符合条件，申请人需要在次年3月1日至6月30日内自行向汇缴地主管税务机关办理汇算清缴申报时扣除。
大病医疗抵扣个税需要的材料有患者姓名、身份证件类型及号码；申请人与纳税人的关系；与基本医保相关的医药费用总金额；医保目录范围内个人负担的自付金额等，每个地方可以需要的资料不同，可以拨打税务部门电话咨询。
在抵扣时对金额做出了明确的规定，扣除医保报销后个人负担超过15000元的部分才可以进行抵扣，一般只有在办理年度汇算清缴时在80000元限额内据实扣除。纳税人应当留存医药服务收费及医保报销相关票据原件（或者复印件）等资料备查。
个人发生的医药费用可以自己扣除或者通过配偶扣除；如果是子女发生的医疗费用可以选择由其父母一方扣除。用户报送的方式有3种，分别是远程办税端、电子或者纸质报表。
