1、体型不同：越南菠萝蜜呈椭圆形中等大小。海南菠萝蜜较长、个头较大。
2、出果率不同：越南菠萝蜜果实圆润饱满果丝较少出果率高。海南菠萝蜜果丝较多出果率较少。
3、甜度不同：越南菠萝蜜果肉呈橙红色肉厚甜脆香味比较浓郁，甜度高达25度左右。海南菠萝蜜果肉呈金HS，甜度比红肉菠萝蜜清淡。
形态特征：
常绿乔木，高10-20m，胸径达30-50cm；老树常有板状根；树皮厚，黑褐色； 小枝粗2-6mm，具纵皱纹至平滑，无毛；托叶抱茎环状，遗痕明显。
叶革质，螺旋状排列，椭圆形或倒卵形，长7-15cm或更长，宽3-7cm，先端钝或渐尖，基部楔形，成熟之叶全缘，或在幼树和萌发枝上的叶常分裂，表面墨绿色，干后浅绿或淡褐色，无毛，有光泽，背面浅绿色，略粗糙，叶肉细胞具长臂，组织中有球形或椭圆形树脂细胞，侧脉羽状，每边6-8条，中脉在背面显着凸起；叶柄长1-3厘米；托叶抱茎，卵形，长1.5-8cm，外面被贴伏柔毛或无毛，脱落。花雌雄同株，花序生老茎或短枝上，雄花序有时着生于枝端叶腋或短枝叶腋，圆柱形或棒状椭圆形，长2-7cm，花多数，其中有些花不发育，总花梗长10-50mm；雄花花被管状，长1-1.5mm，上部2裂，被微柔毛，雄蕊1枚，花丝在蕾中直立，花药椭圆形，无退化雌蕊；雌花花被管状，顶部齿裂，基部陷于肉质球形花序轴内，子房1室。聚花果椭圆形至球形，或不规则形状，长30-100cm，直径25-50cm，幼时浅HS，7-9月间果实成熟，成熟时黄褐色，表面有坚硬六角形瘤状凸体和粗毛；核果长椭圆形，长约3cm，直径1.5-2cm。花期2-3月。
