工资个税的计算公式是应纳税额＝（工资薪金所得减五险一金减扣除数）乘适用税率减速算扣除数，因此工资扣税的计算公式是工资减（工资薪金所得减五险一金减扣除数）乘适用税率减速算扣除数。根据新规定，扣除数是5000元。因此公式也可以表示为工资减（工资薪金所得减五险一金减5000）乘适用税率减速算扣除数。
法律依据：新个人所得税法规定，自2019年1月1日起，纳税人的工资、薪金所得，先行以每月收入额减除费用五千元以及专项扣除和依法确定的其他扣除后的余额为应纳税所得额，依照个人所得税税率表，按月换算后计算应缴纳的税款，并不再扣除附加减除费用。
