故事围绕着一对有着不同寻常情愫的小学生展开。1973年，大阪的一栋废弃建筑内发现了一具男尸，此后19年，嫌疑人之女雪穗与被害者之子桐原亮司走上截然不同的人生道路，一个跻身上流社会，一个却在底层游走，而他们身边的人，却接二连三地离奇死去，警察经过19年的艰苦追踪，终于使真相大白。
《白夜行》成为了东野圭吾小说中被改编为影视作品最多的一部，继2006年的日本电视剧版，2009年的韩国电影版后，2011年的日本电影版也已上映。小说将无望却坚守的凄凉爱情和执著而缜密的冷静推理完美结合。
西本雪穗从小就长得极为漂亮，不仅有“一张明星的脸”，而且还拥有极少同龄人所能拥有的聪慧，却不幸生在一个贫穷家庭中，更加悲惨地是她因此遭到一次次地强暴，因为她的单亲母亲一次次将她出卖给热衷儿童的嫖客。肉体伤痕累累，但她把自己的仅剩的灵魂留在了图书馆，因为在那里她认识了给她沉沉黑暗的心灵光亮的桐原亮司。桐原亮司智力极高，性格却十分阴沉，这也许源自其黑暗的家庭——里面没有任何快乐和温暖，只有耻辱和愤怒：在还没有发现他爸爸患有恋童癖之前，他就一次次听到他妈妈和店里员工交欢的声响。
最终，在再一次发觉他妈妈和店里员工干事的时候，他爬出房顶走出了家，大概想去图书馆找雪穗吧，大概是要在她面前展示高超的剪纸技艺吧，然而却发现自己的爸爸领着自己心爱的女孩走进了废弃的建筑大楼，并且强暴了她。十岁的桐原杀死了爸爸（用那把剪刀），并且让十一岁的雪穗先走。没有谁怀疑到小孩子身上，于是他们重新开始。
但从此两个人成为了Q虾和虾虎鱼，互利共生，融为一体；从此，雪穗行走于地表，桐原沉入地底；从此，雪穗再不以真面目示人，而桐原至今徘徊于黑暗的通风口。这本书里，连他爸爸在内桐原一共杀了五个人，设计了三次强暴案，做皮条客，筹办无限企划盗卖游戏程序，先一步盗走别人的游戏数据公开售卖，复制银行卡成功，杀死奈美江取走其账户中的两千万，最后盗版游戏“超级玛丽”败露从此逃亡……雪穗仍然光彩夺目，舞台中心，借着桐原的帮助一点点达成自己的目的：名誉、地位、金钱、甚至为争夺爱人对自己的好友下手。
在小说最后，案件谜底渐渐揭晓，而直到最后一页，小说真正的主题才到达沸点。小说最后一句写道:“只见雪穗正沿扶梯上楼，背影犹如白色的幽灵。她一次都没有回头。”桐原亮司的无悔付出，已经到了“粉身碎骨浑不怕”的地步，就连雪穗的绝情，也在计划当中。然而这两个双手沾满罪恶的人，却是一对互相依靠的苦难的灵魂。男女主角最大的愿望，就是手牵手在阳光下散步，然而这对于他们却是永远无法企及的奢望。他们只能在用彼此的光亮照耀下的黑夜艰难前行，为了生存，他们付出了无法偿还的代价。
