录取批次不同。一本二本三本指的是高考后本科录取的三个批次，一本是第一批录取的本科大学，一般都是重点的院校。二本是第二批录取的本科大学，一般是普通本科院校。三本就是第三批录取的本科大学，这批次招生的一般都是民办高校，现在一些省份还把二本和三本合并录取，取消了三本。事实上，一二三本都是本科院校，学制为4年，毕业后都能获得国家承认的学历。
学费不同。一本最便宜，其次是二本、三本。不过具体的情况还要具体分析。有的二本民办院校就比三本的院校学费要贵。
除此以外，一二三本的办学范畴略微有差异。一本是公办范畴，二本多数是公办范畴，兼具少数民办。三本一般是独立学院，一般都是民办高校。
一本、二本、三本都是属于“普通高等学校”教育系列，学制都为四年，毕业证书和学位证书都是相同的，是不标明几本的，只标明是本科，都以自己高校的名称具印，都是“普通高等学校”教育证书，所以一、二、三本的毕业生都将获得国家、国际、社会上都承认的本科学历证书。
