皮颜色不同
三花猫就如同它们的名字一样，身体上有三种颜色白色、黑色和橘色，这三种颜色就像是“拼接”在一起，不同颜色之间有明显的界线，打个不恰当的比喻，三花猫身上的颜色就像是挤在颜料格里的颜料，并不相互干扰。而玳瑁猫的皮毛就是被打翻的调色盘，黑色和HS混在一起，主人中有，中有主人。有很多将猫咪身上有没有白色的毛发作为分辨三花和玳瑁的重要依据，在大多数情况下都是管用的，玳瑁猫身上是不容易看到明显的白色。
雄性生育能力
大家应该都有听说过，无论是三花猫还是玳瑁猫，它们绝大多数都是女孩子，雄性的数量是极其少的，不过还是有的。由于决定三花的花色的基因属于性联遗传位于X染色体上，什么是性联遗传呢?就是指物种的性别和它们身上的某种特性遗传有着直接的联系。比较特殊的是雄性的三花猫生殖能力很低，而雄性的玳瑁猫仍具备生殖能力。
受欢迎的程度不同
人们都是外貌主义者，对三花猫的接受程度要比玳瑁猫高很多。有很多人笑话玳瑁猫长得丑，还有很多表示救助的流浪猫，总是小玳瑁被留下来了，没人愿意领养。就颜值而言，玳瑁其实也不差，还是有很多人喜欢它们的，萝卜青菜各有所爱嘛!喜欢的自然是爱如珍宝，不合眼缘那这也是没有办法的。就喜欢的人数来说，喜欢三花的要多一些。不过，认为无论是三花还是玳瑁，饲养得健康都是很好的。
玳瑁猫和三花猫的身体素质还是很不错的。
