猫屎咖啡是由麝香猫在吃完咖啡果后把咖啡豆原封不动的排出，人们把它的粪便中的咖啡豆提取出来后进行加工而成。麝香猫是一种夜行性动物，栖息于丛林地带，它们懂得挑选咖啡树上最成熟最香甜的咖啡果实吃，这样也变相“筛选”出了最优质的咖啡豆。但它们吃进去的咖啡豆往往消化不了，会当做排泄物排出来，之后，人类从猫的粪便中，取出咖啡豆，进行加工、烘焙，成就了猫屎咖啡。
由于麝香猫的食量很小，因此野生麝香猫产出的咖啡豆非常稀有，只有人工养殖才能获得更多的猫屎咖啡。
据说早期印度尼西亚的咖啡农民视专吃成熟咖啡果实的麝香猫为死敌，但不知在哪个时候开始有人想到在麝香猫的粪便中挑出咖啡豆来制作风味独特的咖啡。
各地咖啡专家试过都赞叹不已。从此，当地农民每到咖啡成熟季节，每天都花很多时间在森林内收集麝香猫的粪便。
