灵活就业医保和职工医保是有区别的。区别主要在于：
1、参保对象不同：
灵活就业人员医保主要针对的是在用人单位工作的非本市户籍从业人员，未在用人单位参加职工医保的非全日制从业人员、以临时性和弹性工作等灵活形式就业的人员，还有从事个体劳动的人员等等。而职工医保主要针对的是企事业单位、社会团体等机构的员工等等。
2、缴费情况不同：
以灵活就业人员的身份缴纳医保的话，通常都是自已按一定的基数和比例全额缴纳的，而职工医保则是由职工本人和单位共同缴费的。
还有，灵活就业人员医保可以按月缴费，也可以选择按年缴费；而职工医保通常都是按月缴费的。
至于缴费比例，因为各地的政策都有所不同，所以各地的医保，无论是灵活就业人员医保还是职工医保，缴费比例都可能存在差别。
