袁崇焕杀毛文龙，主要是因为他的做法不合督师袁崇焕的胃口。
先说袁崇焕吧，个人方面，袁崇焕是个喜欢夸海口的人，书上记载他“好为大言”。在出关之前就给崇祯皇帝夸下海口，五年收复失地。结果失地没收回来，清军打到了北京城下。后来他死的很惨跟他喜欢吹牛这个毛病由很大关系。
现在说毛文龙，毛文龙是对大明军事上有功的，他在皮岛对清军进行了有利的牵制。使得清军每次都担心后方的问题。
毛文龙性格比较骄傲，不服上级，桀骜不驯。他有他自己的问题，第一个就是虚报军饷，他手下只有五万人，却报二十万。多余的十五万军饷都被他私吞了。第二个就是他把军队变成了他的私家军，军中要职都让子侄担任。这不符合袁崇焕要统一指挥的要求。第三个就是他对经过皮岛的往来客商收税。当然了，最重要的就是他不听袁崇焕的话，后来袁崇焕想在他身边安插一个文官，他上书皇帝坚决不要。导致袁崇焕记恨在心。
但是在抗清这么重要的时刻，这些都算不得什么要紧的事情。为什么杀毛文龙，因为袁崇焕觉得他功劳居然比自己还大。这样的人不受自己节制，哪天要是造反了，那还了得？不如先杀了的算了。
而且袁崇焕曾经说五年复辽的诺言实现不了了，怎么办呢？找个人来背锅吧，这个人就非毛文龙莫属了。所以毛文龙的死有他自己的原因，但是他肯定罪不至死，袁崇焕在这里担负非常大的责任。
