蜥蜴用肺呼吸。蜥蜴属于爬行动物，爬行动物一般都用肺来呼吸。蜥蜴也不例外，它们也是用肺呼吸的。因为它们是用肺呼吸的，所以它们不能在水中呼吸，只能在陆地上呼吸。因此，它们是不能长时间泡在水里的。它们对水的依赖性不强，有一些不太依赖水的蜥蜴品种，甚至可以在比较干旱的沙漠里面生存。
跟两栖动物相比，蜥蜴的肺部结构比较复杂，功能也比较完善，只借助肺部就可以顺利呼吸，不用再借助其它器官辅助就能够将足够的氧气供给身体的需要，并且将身体内部产生的二氧化碳排出体外。肺部这一构造是比较高等的动物才有的，因为肺部是一种高级构造，呼吸效率比较高。
