大蒜为弦线状浅根性根系,无主根,主要根群分布在5~25厘米内的土层中,横展直径为30厘米。在植物形态学上,鳞茎本身是由变态枝条发育而来,其节间短缩为―鳞茎盘,茎盘的基部和边缘着生根系,其上部长叶和芽的原始体。经过花芽分化后,顶芽形成花薹,侧芽膨大形成蒜瓣。
大蒜所含化学成分十分复杂,除大蒜特有的活性物质含硫有机化合物之外,还含有丰富的多糖、蛋白质、挥发油、氨基酸、维生素、皂苷类化合物、黄酮类化合物、多酚类化合物、凝集素、前列腺素、生物活性酶以及丰富常量和微量元素等物质。大蒜所含有的这些复杂的成分是大蒜药理活性的物质基础。