1、定义不同。玉的定义：在矿物学中，严格的玉的定义只包括了极少几个玉石品种，如翡翠、和田玉等，其中并没有玉髓。玉髓的定义：玉髓是一种矿物，又名“石髓”，常被划分在“玉石”这一大范围内。
2、成分不同。玉：主要成份均为Ca2（Mg，Fe）5Si8O22（OH）2）；玉髓：化学主要成分是二氧化硅（SiO2）。
3、特征不同。玉：因为玉的种类很多，无法统一特点。玉髓：玉髓质地细腻具有隐晶质结构，颗粒微小，肉眼无法看出。
作为一种二氧化硅的集合体，玉髓可以说是涵盖品类最广的一种宝石了，市面上的玉髓大致可以分成三个类别，分别是普通玉髓、满脑及碧石，而普通玉髓，便是我们口口相传的“玉髓”了。缘起于一个“髓”字，玉髓一度被说成是玉精华，其实并不是这样，作为一个独立的品类，玉髓本身是有着自己的价值的，它的结晶体颗粒细腻且体积小，外观呈现半透明或透明的性状，并且，它的颜色十分丰富多样，但本质上却与玉石相去甚远。
玉髓属于隐晶结构，质地细腻，晶莹剔透，由于二氧化硅的结合体特性，可以呈现多种透明度不同的过度、演进与变化；不过也因此导致高温下容易发生褪色的现象，而且比重相对玉石来说，要轻的很多。
而玉石则不同，更加稳定的晶体排列结构，而且多部分呈现多矿物集合体的特性，虽然也是呈现出不同程度的透明度变化，但本质上是由于玉石内部颗粒结构排列而决定的，尤其和田玉，其晶体颗粒度极细，质地也十分的密实。
