内蒙古叫旗是因为清代初期，清政府为了加强对蒙古族的统治，将内蒙古、外蒙古都分成若干单位，而实行军政合一的八旗制度，以不同颜色的旗来区分军队，故称为旗。旗本为满语“固山”的汉名，是清朝八旗兵的最大编制单位，分别有满洲八旗、蒙古八旗和汉军八旗。所以，旗即是行政区划单位，也是军事编制单位，便流传下来，沿用至今。
八旗起源：
八旗制度最初源于满洲（女真）人的狩猎组织。结伴而行的狩猎活动因人数增多而需统一指挥，其指挥者称为牛录额真，这个多人集体即称为牛录。女真人在对外防御与征伐过程中采取了以牛录额真统领牛录的组织形式，从而牛录组织具有了军事职能。为便于统一指挥大规模的围猎或作战，需将若干个牛录组成一个更大的单位，以旗帜为标志作导引而不使方位错乱。旗帜在满语中称为“固山”，因而这个高于牛录的最大的单位即称为固山，汉语称“旗”。
