北京二类经济适用房和商品房的区别如下：
1、北京二类经济适用房一般是回迁性质或康居、安居性质的房屋，按经济适用住房管理的其他类房屋。在房产证上，房屋性质处会标示“按照经济适用住房管理”。二类经适房上市交易不受是否满五年限制，只要取得产权证就可以上市交易。上市交易时，契税、个税、增值税和商品房是一致的，但需按照房屋成交价格的3%缴纳土地出让金，缴纳土地出让金后，其产权性质变为商品房。
2、北京商品房是指房地产开发经营企业，经批准用于市场出售而建造的房屋。商品房销售对象范围广，只要取得产权就可上市交易，没有交易的限制。在房产证上，房屋性质处会标示“商品房”。商品房上市交易时，需缴纳契税、个税、增值税等税费。
一类经适房和二类经适房的区别是什么？
1、概念不同
(1)一类经济适用房：面向社会公开发售的经济适用房。是指由城市政府组织房地产开发企业或者集资建房单位建造，以微利价向城镇中低收入家庭出售的住房。
(2)二类经济适用房：一般是回迁性质或康居、安居性质的房屋，还有一部分是单位集资建房和一些产权不明确的房屋，政府又回收再出售的回流房，按经济适用住房管理的其他类房屋。
2、交易条件不同
(1)一类经济适用房的房本是两限房房本。必须满5年后才可以上市出售，且上市前，先由政府决定是否优先回购，政府决定不回购方可出售。
(2)二类经适房上市交易不受是否满5年限制，只要取得产权证就可以上市交易。交易时需按照房屋成交价格的3%缴纳土地出让金，缴纳土地出让金后，其产权性质变为商品房。
3、交易费用不同
(1)一类经济适用房：一类需缴纳综合地价款，08年4月11日前的经适房需要交10%，2008年4月11之后的需要缴纳差额70%;差额指原购经适房价格和出售时同地段房屋状况基本相似的普通商品房价格差，而且一类经济适用房在2015年的时候已经停止了，目前市面上是没有的。
(2)二类经济适用房：契税、个税、增值税与商品房一致，但交易时需按照房屋成交价格的3%(以网签价格为准)缴纳土地出让金。
4、房本上房屋性质不同
(1)一类经济适用房的房本是两限房的房本
(2)二类经济适用房在房产证上房屋性质处会标示“按照经济适用住房管理”。
